বাংলাদেশ জাতীয় জাদুঘরের বিভিন্ন বিভাগ ও শাখাগুলোর মধ্যে প্রকাশনা একটি অন্যতম গুরুত্বপূর্ণ শাখা। প্রকাশনা শাখা বাংলাদেশ জাতীয় জাদুঘরে সংগৃহীত বিভিন্ন নিদর্শনের গবেষণালব্ধ পাণ্ডুলিপি ও জাদুঘর সম্পৃক্ত অন্যান্য বিষয়াদির পাণ্ডুলিপি দিয়ে বিজ্ঞজনের মতামত নিয়ে বিভিন্ন ধরণের গবেষণা গ্রন্থ, স্মারকগ্রন্থ, জার্নাল, বই, ক্যাটালগ, অ্যালবাম, বার্ষিক প্রতিবেদন, জাদুঘর সমাচার, ফোলিও, ব্রোশিউর, নির্দেশিকা, পোস্টার, ভিউকার্ড, লিফলেট প্রভৃতি প্রকাশ করে থাকে। প্রকাশনাগুলোর মাধ্যমে বাংলাদেশের ইতিহাস, ঐতিহ্য, কৃষ্টি ও সংস্কৃতি সম্পর্কে দেশ-বিদেশের গবেষক, লেখক, কবি, সাহিত্যিক, সাংবাদিক, বুদ্ধিজীবী, শিক্ষার্থী ও পাঠকগণকে অবহিত করা এবং অব্যাহতভাবে প্রচার করা হয়। এ শাখার মাধ্যমে পরিচালিত “শুভেচ্ছা স্মারক বিপণি” থেকে জাদুঘরে আগত দর্শনার্থীরা বিভিন্ন ধরণের প্রকাশনা ও স্মারক ক্রয় করতে পারেন। জাদুঘরের প্রকাশনা শাখার বিভিন্ন প্রকাশনা “পাঠক সমাবেশ, ঢাকা” ও “বাতিঘর, চট্টগ্রাম” এর মাধ্যমে বিক্রয় করা হয়। এছাড়া বিভিন্ন সরকারি ও স্বায়ত্ত্বশাসিত প্রতিষ্ঠানের চাহিদা মোতাবেকও এর প্রকাশনা বিক্রয় করা হয়। এ শাখা বিভিন্ন প্রকাশনা নিয়ে “আন্তর্জাতিক কলকাতা পুস্তক মেলা”, বাংলা একাডেমির “অমর একুশে বইমেলা” এবং জাতির পিতা বঙ্গবন্ধু শেখ মুজিবুর রহমানের জন্মবার্ষিকী ও জাতীয় শিশু দিবস উপলক্ষে টুঙ্গিপাড়াস্থ বঙ্গবন্ধু-সমাধি কমপ্লেক্সে অনুষ্ঠিত মেলায় অংশগ্রহণ করে আসছে।

বাংলাদেশ জাতীয় জাদুঘর এপর্যন্ত বেশ কয়েকটি গুরুত্বপূর্ণ গবেষণা গ্রন্থ প্রকাশ করেছে। দেশ-বিদেশের গবেষক, লেখক, সাহিত্যিক, বুদ্ধিজীবী, শিক্ষার্থী ও পাঠকদের নিকট এ গ্রন্থগুলো সমাদৃত হয়েছে। যেমন: বঙ্গবন্ধু : মৃত্যুঞ্জয়ী মহানায়ক, Iconography of Buddhist & Brahmanical sculptures in the Dacca Museum, Islamic Art Heritage of Bangladesh,  Bengal Sculptures : Hindu Iconography upto C. 1250 A.D., The Aesthetics & Vocabulary of Nakshi Kantha, মহাস্থান, আলোকচিত্রে সেকালের ঢাকা, Centenary Commemorative Volume, জয়নুল আবেদিন: শিল্পী ও শিল্পকর্ম, বাংলাদেশের দারুশিল্প, A Revered Offering To Nalini Kanta Bhattasali: A Versatile Scholar, A Descriptive Catalogue of the (i) Arabic  and Persian Inscriptions, (ii) Terracotta, (iii) Mollusc Shells and (iv) Textile Objects In Bangladesh National Museum, Master Artists of Bangladesh: Zainul Abedin, ২১ ফেব্রুয়ারি ১৯৫২ ছাত্র হত্যাকাণ্ড: এলিস কমিশন রিপোর্ট, Women In Bangladesh Liberation War: Rediscovered In  Madonna Series, ঐতিহ্যবাহী জামদানি নকশা, নজরুল পাণ্ডুলিপি ইত্যাদি।

বি.দ্র: বাংলাদেশ জাতীয় জাদুঘরের প্রকাশনা শাখার মাধ্যমে পরিচালিত শুভেচ্ছা স্মারক বিপণিতে বাংলাদেশের ইতিহাস, ঐতিহ্য, কৃষ্টি ও সংস্কৃতি সম্পর্কিত অন্য প্রতিষ্ঠান কর্তৃক প্রকাশিত বা তৈরিকৃত নির্বাচিত কিছু গুরুত্বপূর্ণ প্রকাশনা ও অন্যান্য স্মারক দ্রব্যাদি বিক্রয় করা হয়।